灵活就业人员参加医疗保险有两种选择，可以选择参加职工医疗保险，也可以参加城乡居民医疗保险。在选择医疗保险时，应该考虑自己的健康状况和经济条件。职工医保通常提供更高的待遇标准，但缴费金额也更高。灵活就业人员应该根据自己的实际情况和需求来选择最适合自己的医疗保险类型。